Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Clstn1Q9EPL2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Clstn1Q9EPL2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Clstn1Q9EPL2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Clstn1Q9EPL2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Clstn1Q9EPL2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Clstn1Q9EPL2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Clstn1Q9EPL2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Clstn1Q9EPL2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Clstn1Q9EPL2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clstn1Q9EPL2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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