Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpr88Q9EPB7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms