Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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