Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms