Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp12Q9D9M2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms