Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B7

Prr30, Proline-rich protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr30Q9D9B7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prr30Q9D9B7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Prr30Q9D9B7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Prr30Q9D9B7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Prr30Q9D9B7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Prr30Q9D9B7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Prr30Q9D9B7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prr30Q9D9B7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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