Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms