Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Phf6Q9D4J7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms