Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krt20Q9D312 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms