Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms