Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Spns3Q9D232 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms