Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rtl8bQ9D1F0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms