Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Mrpl28Q9D1B9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Mrpl28Q9D1B9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Mrpl28Q9D1B9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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