Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms