Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms