Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mms19Q9D071 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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