Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ChtopQ9CY57 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms