Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms