Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms