Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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