Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms