Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms