Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q9CRC3 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms