Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms