Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Q9CQC3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Q9CQC3 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Q9CQC3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Q9CQC3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Q9CQC3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Q9CQC3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Q9CQC3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CQC3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Q9CQC3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Q9CQC3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Q9CQC3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Q9CQC3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9CQC3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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