Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms