Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Epdr1Q99M71 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Epdr1Q99M71 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Epdr1Q99M71 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Epdr1Q99M71 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Epdr1Q99M71 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Epdr1Q99M71 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Epdr1Q99M71 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Epdr1Q99M71 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Epdr1Q99M71 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Epdr1Q99M71 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Epdr1Q99M71 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Epdr1Q99M71 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Epdr1Q99M71 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Epdr1Q99M71 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms