Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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