Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cstf3Q99LI7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms