Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RtcbQ99LF4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RtcbQ99LF4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RtcbQ99LF4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RtcbQ99LF4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RtcbQ99LF4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RtcbQ99LF4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RtcbQ99LF4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RtcbQ99LF4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RtcbQ99LF4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RtcbQ99LF4 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms