Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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TrabdQ99JY4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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TrabdQ99JY4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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TrabdQ99JY4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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TrabdQ99JY4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1537.4 ms