Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms