Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms