Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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