Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms