Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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