Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Tdrd3Q91W18 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Tdrd3Q91W18 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Tdrd3Q91W18 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Tdrd3Q91W18 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms