Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Smg8Q8VE18 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Smg8Q8VE18 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Smg8Q8VE18 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Smg8Q8VE18 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Smg8Q8VE18 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Smg8Q8VE18 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Smg8Q8VE18 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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