Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Stx18Q8VDS8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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