Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms