Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Rab11fip5Q8R361 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Rab11fip5Q8R361 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Rab11fip5Q8R361 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rab11fip5Q8R361 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab11fip5Q8R361 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab11fip5Q8R361 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rab11fip5Q8R361 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab11fip5Q8R361 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab11fip5Q8R361 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rab11fip5Q8R361 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rab11fip5Q8R361 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab11fip5Q8R361 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rab11fip5Q8R361 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rab11fip5Q8R361 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11fip5Q8R361 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab11fip5Q8R361 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rab11fip5Q8R361 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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