Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms