Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L0

Ddx54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx54Q8K4L0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddx54Q8K4L0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddx54Q8K4L0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddx54Q8K4L0 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddx54Q8K4L0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddx54Q8K4L0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddx54Q8K4L0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddx54Q8K4L0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx54Q8K4L0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx54Q8K4L0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx54Q8K4L0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx54Q8K4L0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx54Q8K4L0 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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