Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbm48Q8K2X2 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms