Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Abcf3Q8K268 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Abcf3Q8K268 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Abcf3Q8K268 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Abcf3Q8K268 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Abcf3Q8K268 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Abcf3Q8K268 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Abcf3Q8K268 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Abcf3Q8K268 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Abcf3Q8K268 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Abcf3Q8K268 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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