Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1eQ8K202 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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