Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms