Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rasgef1bQ8JZL7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rasgef1bQ8JZL7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rasgef1bQ8JZL7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rasgef1bQ8JZL7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rasgef1bQ8JZL7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rasgef1bQ8JZL7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms