Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms