Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.1 ms